Обычный современный парень, только что закрывший последний вышедший на тот момент выпуск манги про Наруто и порядком уставший от бесконечного могущества злодеев, засыпает с мыслью о том, как сам хотел бы родиться в этом мире — и просыпается младенцем по имени Рью, сыном шиноби из клана Узумаки и матери из клана Нара. Сохранив память и знание будущих событий, он с рождения пользуется преимуществами обеих линий: огромные запасы чакры и редкий дар сенсора — от отца, цепкий, неторопливый ум — от матери. Пока сверстники только учатся ходить, Рью уже осваивает контроль чакры под присмотром деда — мастера печатей, мечтает о собственном пути фуиндзюцу и с лёгкой завистью наблюдает за двоюродным братом Шикаку, будущим гением тактики. Но детство обрывается рано: отец погибает во время очередной поездки в родную деревню, а из обрывков подслушанных разговоров взрослых Рью узнаёт, что великие деревни шиноби готовятся к новой войне и что богатства и секретные техники клана Узумаки давно и жадно манят сильных мира сего — Узушиогакуре в опасности, и к этой опасности причастны те, кому доверяет сама Коноха. Когда мать наконец решает отвезти сына к деду по отцовской линии в сопровождении джонинов из кланов Хьюга и Сенджу, дорога к деревне Водоворота становится для мальчика первым шагом на пути к тому, чтобы изменить историю, которую он когда-то знал только по страницам книги.