Куро Шизуматта просыпается в полной темноте, а выходит из неё уже шестилетним сиротой Конохи — за три дня до начала занятий в Академии. В его распоряжении оказывается система, превращающая повседневные действия и тренировку в путь развития, но тело ребёнка, слабая чакра и мир Наруто требуют терпения. Куро начинает с малого: осматривает деревню, учится управлять чакрой и скрывает от окружающих, насколько быстро меняется. Для него путь шиноби начинается не с великой техники, а с попытки понять, кем он стал.