Через несколько недель после победы над Тонери Оцуцуки, Наруто отправили на конфиденциальную миссию S-ранга. Прошло больше года, и теперь он собирается вернуться в Коноху. Однако, несмотря на нынешний мир, угроза со стороны Оцуцуки всё ещё таилась вокруг. Что, если Оцуцуки начали появляться во время 'Пустой Эпохи' до того, как Наруто стал Хокаге?