Будущий Какаши из параллельной вселенной неожиданно вернулся в ночь великой трагедии и изменил ход истории. Игнорируя законы мира ниндзя, он перевернул всё с ног на голову, решив действовать по-своему.

Без системы и поддержки, он убил Данзо, отказался от титула Хокаге и стал ниндзя-повстанцем, ведущим непринужденную, но загадочную повседневную жизнь. В его окружении — Наруко, версия Наруто из этой измененной реальности, и Теруми Мэй. Всё тот же мир, но совершенно иные сюжеты. Те же герои, но их судьбы претерпели радикальные изменения, где решительные убийства неожиданно соседствуют с теплом и заботой.

Какаши, с характерной задумчивостью, размышляет: "Теперь, когда Наруто стала Наруко, Хината тоже изменилась..."

Эта новая реальность только начинала раскрывать свои секреты.