Из-за прихоти Рюка, бросившего Тетрадь в мир людей, хаос охватил оба измерения. Чтобы восстановить равновесие, Король Смерти навсегда запечатал проход между мирами. Но для исправления главной ошибки ему пришлось пойти дальше: он стер имя Эл из Тетради, позволив детективу вернуться в мир живых. Теперь Эл обречен скитаться по земле, пока смерть не настигнет его естественным образом и не вернет в небытие.
Человечество давно утратило память о Тетради, но Эл продолжает свою работу. Расследование дела могущественной Черной Организации вновь приводит его в Токио.
Эдогава Конан, ФБР, ЦРУ, люди в черном... Когда все фигуры расставлены на шахматной доске, начинается новая партия в вечной дуэли Черного и Белого.