История начинается с Норы, которая вместе со своими друзьями Череном и Бьянкой отправляется в путешествие по региону Юнова, чтобы принять участие в Лиге Покемонов. Нора мечтает о гармонии между людьми и покемонами и надеется положить конец коррупции в Покемон Лиге, которая вредит экосистемам региона. Её путь пересекается с таинственным N, который утверждает, что понимает речь покемонов и стремится к их «освобождению», а также с бывшим Лидером Стадиона Верделлом, который становится её наставником.
Сюжет следует основной линии игр Pokémon Black и White, но с дополнительными сюжетными линиями и глубокой проработкой мира и персонажей. История исследует темы дружбы, целеустремленности, ответственности и поиска своего пути, как для людей, так и для их покемонов-партнёров. Путешествие Норы усложняется деятельностью Команды Плазма и личными тайнами её нового наставника.
