Пятнадцатилетний мастер древнего боевого искусства калариппаятту гибнет от отравленной стрелы в ту же ночь, когда неизвестные убивают его учителя и сжигают дом в сибирской глуши. Открыв глаза заново, он обнаруживает себя младенцем в приюте деревни, скрытой в листве, — по соседству с крикливым светловолосым мальчишкой по имени Наруто. Сохранив память и характер взрослого человека, герой, получивший новое имя Сенен Танаси, с первых месяцев жизни заново учится управлять телом, тайно разгоняет чакру во время медитаций и уже в шесть лет сдаёт вступительный экзамен в академию шиноби, поразив приёмную комиссию техниками, которые обычно осваивают только выпускники.
Чтобы прокормить себя и не привлекать лишнего внимания, он подрабатывает в больнице — сперва разносит утки по палатам, потом помогает угрюмому санитару в морге собирать тела погибших шиноби и постепенно перенимает у него азы медицинских техник. Его успехи не остаются незамеченными: за мальчиком начинает следить АНБУ, а сам Хокаге интересуется, что за талант вырос в приюте у всех на глазах. Подружившись с ребятами-сиротами и однажды случайно спасая маленького Наруто от компании хулиганов, Танаси обрастает первым в жизни кругом близких людей — а после досрочного выпуска из академии попадает в команду, приставленную присматривать за кланом Учиха, чьё настороженное внимание к новичку не сулит ничего простого.